Изучение паразитофауны региона – фундаментальная задача рыбохозяйственной науки. Сегодня идентификация паразитических червей осуществляется исключительно при помощи изучения морфологических характеристик, что является достаточно трудоемким процессом, требующим много времени. Использование же молекулярно-генетических тест-систем позволит проводить данный анализ в разы быстрее.
Цель исследования заключается в уточнении количества видов эустронгилид, сезонно заражающих рыб водоемов Ростовской области. В Азово-Черноморском бассейне подтверждено присутствие паразитических личинок одного вида – Eustrongylides excisus. Согласно сообщениям ихтиопатологов Ростовской области, в реке Дон и сопутствующих водоемах потенциально могут существовать еще два вида – E. tubifex и E. mergorum.
Проект находится на стадии сбора биопроб личинок и анализа разных методов выделения их генетического материала. Следующим этапом станет серия генетических анализов, включая полимеразную цепную реакцию (ПЦР), которые позволят расшифровать генетический код исследуемых объектов и сравнить его с референсными последовательностями для выявления возможных отличий.
Попытки отсеквенировать эти личинки – прочитать последовательность их ДНК с целью изучения их видового разнообразия в нашей стране не проводились. Аналогичные исследования проводились за границей, однако в банке генетической информации сохранена всего лишь одна последовательность ДНК данного рода, что говорит об ограниченных данных в этой области.
Исследование позволит определить актуальный видовой состав паразитофауны водоемов Ростовской области. В перспективе планируется апробация молекулярно-генетических методик на других родах круглых червей с последующим созданием комплекса тест-систем.
Эустронгилиды – личинки круглых червей Eustrongylides, обитающие в полости тела и мышечной ткани рыб.